高企申報的意義不必多說，從稅收優惠到品牌形象的提升，對企業來說都是一個很好的機會。首先看企業不能通過認定的幾種可能:
1、成長性不夠好的企業，且授權的知識產權少于10個；
2、研發費用日常做帳不規范，被稅務抽查后提供不出有效的證明；
3、總收入中，貿易性質產品的收入占比較大；
4、專項審計時從成本中挖掘研發費；
5、網上申報時，企業提供的證明附件材料不充分。
6、企業近三年發生稅務處罰、重大安全、重大質量事故或嚴重環境違法行為。
    那么，申報前做好哪些準備呢？
1.申報高企我們要查閱哪些政府文件
    仔細研讀《高新技術企業認定管理辦法》（國科發火〔2016〕32號）《高新技術企業認定管理工作指引》（國科發火〔2016〕195號）是重中之重，任何脫離認定管理辦法和管理工作指引的政策解讀當然都是靠不住的。2016年與2008年版本有所改動
2.仔細研讀以上兩文件后，進行企業自查
    根據高新技術企業認定條件和評分標準，對照企業的知識產權、科技成果、組織管理水平、財務情況進行綜合評價，并聘請財務中介機構進行研發費用規劃，并針對財務情況，納稅情況進行自查，保證企業未有稅務風險。
3.進行高新技術企業申報規劃
（1）設立研發機構
設立研發機構是企業研發活動的起始，是財務部門歸集各項研發經費的依據。企業應當根據企業實際情況及時建立企業的研發中心將企業從事研發活動且高企認定要求的相關人員納入研發中心統一管理，研發中心由分管副總經理或者總經理直接領導。
注意：研發人員的確定要符合高企認定條件中對研發人員的屬性、比例要求。2016年開始工資表及公司組織架構里面都體現出研發部門。   
（2）研究開發項目立項
研究開發項目是財務部門分配各項研發費用的依據，也是企業申請技術開發費用加計扣除的依據，是企業申報高新技術企業的必備條件。企業應當將企業實際將要從事的研發活動，按照規定的標準格式（主要是研發計劃書，詳見附件）申請立項，經分管領導批準后從事相關研發活動。
（3）研究開發項目備案
科技備案是指企業將自已立項的科技研發項目及時報所屬科技部門備案，為財務部門爭取技術開發費用的加計扣除作準備。根據稅務部門檢查的要求，科技備案是認定研發項目的前提條件，按要求在所得稅匯算清繳前提交相關材料，可享受150%的研發費用加計扣除。
注意：科技備案的研發項目的立項應當結合企業實際狀況填寫，當立項預算金額與企業實際發生的研發費用金額相差10%以上的，需要重新立項并說明相關原因。
（4）研發費用核算
研發費用核算是指財務部門根據研發機構的研發項目按月對企業發生的各項費用進行核算，并在各項目間進行分配。準確核算研發費用是建立企業高新技術研發體系的關鍵之一，是準確申報技術開發費加計扣除和申請享受高新技術企業所得稅優惠的必備條件。無法準確核算企業的研發費用，既使獲取了高新技術企業認定，也無法享受稅收優惠。
（5）研發設備管理
研發設備管理是指在建立研發機構的同時，對企業的固定資產進行分類，將研發用的或者與研發活動相關的設備，如研發中心的房屋、土地、辦公設備、試驗設備、檢測儀器、小試中試設備等，單獨造冊管理。研發設備的數量不宜過多，也不宜過少，一般工業企業以所提折舊額占全部研發費用的15%-25%為宜。設備科和技術部門每月統計研發設備在各個研發項目間的使用情況（工作量分配），財務部根據工作量各研發項目分配應當負擔的折舊。
（6）知識產權申報
知識產權申報是指技術部門要根據企業研發項目的立項情況及時申報企業的知識產權。知識產權是證明企業研發活動具體高新技術企業特征的重要材料，也是企業研發成果的重要體現，是企業高新技術企業申報和復審的必備條件。
注意：知識產權申報要符合高企認定對知識產權的技術先進程度、核心支撐作用、數量、獲得方式等評價要求。
（7）科技成果轉化證明材料及高新技術產品申報的準備
企業根據研發活動的開展情況，及時做好新技術與新產品、新工藝、新材料的銜接應用，并提供佐證材料（包括對應用相關技術的軟件產品及高新技術產品的申請，產品質量運行情況的檢測報告）。
特別是企業應當高度關注高新技術產品的認定，隨著高新技術企業認定管理的嚴格化，有無高新技術產品證書將成為判斷企業銷售的產品是否屬于高新技術產品的重要標準。高新技術產品的認證切記取怪名或者過于繁雜的名稱，注意名稱的概括性，以方便財務部門歸集高新技術產品銷售收入。（8）高新技術產品收入核算、軟件產品登記
高新產品收入核算是指財務部門應當逐步分類核算高品和非高品的收入，根據高新技術產品類別分類核算各項高新技術產品收入，注意發票名稱應當與高品名稱一致，如無法保持一致的，至少在發票上模糊開票，附件清單里注明是哪一類高品收入，以方便財務核算和稅務審核。
特別是對于有軟件產品銷售的企業，要及時申請軟件產品登記（提供軟件著作權證書、軟件產品檢測報告等）。增值稅一般納稅人銷售其自行開發生產的軟件產品，按17％的法定稅率征收增值稅后，對其增值稅實際稅負超過 3％的部分實行即征即退政策。
（9）研究開發組織管理的建立
    根據企業實際及研發機構建立情況，及時建立與高校的產學研合作項目（簽訂產學研合作協議）、企業內部研究開發費用核算制度、企業研究開發人員績效管理制度
4.知識產權準備是重中之重
    知識產權與高新評審指標中的兩項評分（知識產權和科技成果轉化能力共計60分）密切相關，知識產權的數量和質量對高企打分起著至關重要作用。
    2016年新政策對知識產權的評分作出較大調整，不再只是數量多就能拿高分的局面了，現在保證量的同時還要體現質，這個質就表現在知識產權類型、與產品相關度、技術先進性等方面（發明專利的得分高于實用新型或軟著）。所以發明專利的重要性不言而喻，建議企業將申請發明專利提上議程為以后高企申報打牢基礎。
    小編提醒：滿分檔需要企業平均每年5項以上（成立3年以上的企業，至少需要15項以上專利及對應的產品才能達到滿分檔）。所以知識產權數量少的企業，盡快啟動實用新型和軟著的申請（實用新型從申請到授權一般為6-9個月，軟著一般1-2個月）。
5.做好研發加計扣除以免后顧之憂
1、重點抽查，一票否決
（1）從2016年開始，高企材料上交后，稅務部門加大了對沒有做過加計扣除的企業重點稽查，在需企業提供專項審計研發費用與匯算清繳的研發費金額不一致的情況說明外，還要對企業的研發費用明細帳進行審核，甚至到企業進行實地帳務核實。
（2）對專項審計從生產成本中列支研發費的企業，稅務部門對高企評審具有一票否決權。
（3）企業的年度報表，若管理費用下對研發費用有單獨列支，建議要達到高企對研發費占銷售收入的比例要求。
2、追溯3年
    企業符合研發費用加計扣除條件而在2016年1月1日以后未及時享受該項稅收優惠的，可以追溯享受并履行備案手續，追溯期限最長為3年。也就是說，2017年擬申報高新的企業，如果前三年研發費用加計扣除沒做的，則在2016年年度匯算清繳前可以做三年追溯。